تأسست كاريتاس مصر عقب حرب عام 1967 كمنظمة إغاثية لتقديم الخدمات والمساعدات والأدوية للسكان المتضررين من الحرب في منطقة القناة. ونظرًا لدورها الإنساني الفاعل، تم تسجيل كاريتاس مصر رسميًا كجمعية أهلية بوزارة الشؤون الاجتماعية تحت رقم 1150 لسنة 1967.
وتُعد كاريتاس مصر عضوًا في اتحاد كاريتاس الدولية (Caritas Internationalis)، الذي يعمل في 162 دولة حول العالم، حيث تركز جميع المنظمات الأعضاء على الإغاثة، والاستجابة للطوارئ، والعمل الإنساني، والتنمية المحلية، وتقديم الخدمات الاجتماعية للفئات الفقيرة والمهمشة.